Méthode pour séparer l'ADN ou protéines en modifiant le pH à l'intérieur d'un gel. Comme les molécules migrent dans le champ électrique, ils rencontrent des conditions de dénaturation qui ralentissent leur mobilité. Différentes molécules réagissent différemment à la condition de la dénaturation et donc de répondre à un niveau de gravité différent dénaturant (résultants en une perte de mobilité à un point différent dans le gel).