EBM integruje znalosti o ekologické vztahy řídit dopady v rámci ekosystému. Účinné uplatňování EBM by: (1) za ekologické procesy, které působí uvnitř i vně hranic ekosystémů (2) uznává důležitost rozmanitosti druhů a stanovišť i (3) pojmout lidské použití a výhody v rámci zachování požadavků.